目前部分省市對余熱余壓發電等資源綜合利用自備電廠并網或上網，收取1分到3分不等的并網費，經過記者了解，對自備電廠進行征收系統備用費、重大水利工程建設基金國家有相關政策規定。
2004年國家發展改革委、國家電監會以發改電〔2004〕159號文件聯合下發了《關于進一步落實差別電價及自備電廠收費政策有關問題的通知》，通知規定：與電網連接的所有企業自備電廠（含資源綜合利用、熱電聯產電廠）均應向接網的電網公司支付系統備用費。該文件作為目前各省進行自備電廠收費的政策依據。
通知規定，系統備用費標準按合理補償成本的原則確定，可參照所在省電網現行大工業銷售電價中基本電價水平（按變壓器容量計收標準）確定，也可按自備電廠與電網已協商一致的水平確定。系統備用費按并網協議中約定的電網所能提供的備用容量交納；對沒有約定備用容量的，按企業變壓器容量或最大需量扣減電網向其供電的平均負荷確定。具體水平由省級價格主管部門按以上原則制定，報國家發展改革委備案。
從目前各省市對該文件的實施情況來看，自備電廠系統備用費征收標準基本控制在每千瓦時1.5分錢以內。內蒙古自治區對資源綜合利用（如利用余熱、余壓或煤矸石發電等）和熱電聯產自備電廠征收的系統備用費為2分/千瓦時。
另外，根據《財政部 國家發展改革委 水利部關于印發〈國家重大水利工程建設基金征收使用管理暫行辦法〉的通知》（財綜[2009]90號）、《財政部關于征收國家重大水利工程建設基金有關問題的通知》（財綜［2010］97號）。企業自備電廠將要交納重大水利工程建設基金，雖然各地征收比例不同，但這筆費用成為企業一筆不小的開支。
據了解，自備電廠重大水利工程建設基金江蘇征收標準為1.491分/千瓦時，河北對自備電廠已經取得“資源綜合利用認定證書”的征收標準為0.7分/千瓦時，未取得的征收標準為2.15分/千瓦時。
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